上海市微生物学会

秋韵申城，群贤汇聚。2026年9月19日上午，第十二届临床微生物学与感染病学学术论坛暨2026年中美临床微生物学专家研讨会在上海华夏假日酒店三楼华夏厅举行。

本次论坛由上海市微生物学会主办，美国华人临床微生物协会协办，上海市公共卫生临床中心、上海市东方医院（同济大学附属东方医院）和上海市细菌真菌耐药监测网共同承办。来自国内外医疗机构、高校和企业的临床微生物专家、感染性疾病医师及新技术研发人员齐聚一堂，围绕感染性疾病精准诊断策略、临床微生物学科发展以及微生物致病机制研究等热点话题展开深入交流，共同探讨AI和组学新时代感染性疾病诊疗及公共卫生防控的机遇和挑战。

会议开幕式由上海市公共卫生临床中心医学检验科朱召芹教授主持。上海市公共卫生临床中心副主任张建良教授、上海市微生物学会理事长袁正宏教授、美国华人临床微生物协会会长姚笃志教授和上海市微生物学会临床微生物学专业委员会主任委员吴文娟教授致开幕辞。四位专家对与会嘉宾和同道的到来表示热烈欢迎，并指出随着新发病原体、微生物耐药问题以及免疫低下人群精准诊疗等需求的不断增加，临床微生物学在感染性疾病诊断、治疗及防控中的作用日益突出，此次中美临床微生物学专家研讨会为国内外专家搭建了良好的学术交流平台，希望通过前沿研究成果与临床实践经验的深入交流，进一步促进临床微生物检测技术创新与学科发展，加强多学科及国际间的交流与合作。

会议合影结束后，上午学术报告正式开启。

开场演讲嘉宾是来自加州大学旧金山分校的 Charles Chiu 教授，他作了题为《AI-enabled Metagenomic and Host RNA Profiling for Precision Diagnosis of Infectious Diseases》的专题报告。Chiu 教授从感染性疾病诊断中病因不明比例较高这一临床难题出发，介绍了宏基因组二代测序（mNGS）在中枢神经系统感染等疾病中的无偏倚病原检测价值。在其介绍的 PDAID 研究中，临床验证的脑脊液 mNGS 检测显示出较好的诊断性能，并在部分病例中直接影响临床治疗决策。进一步地，他重点介绍了基于宿主 RNA 表达谱的人工智能分析思路，指出单纯病原检测有时难以区分真正感染、定植、污染或炎症性再激活，而宿主反应信息有望帮助鉴别感染性与非感染性炎症、辅助判断病原类别并支持抗感染治疗优化。报告还展示了自动化 mNGS 报告及机器学习分类器的探索，强调未来精准感染诊断可由“病原体检测”进一步走向“病原体+宿主反应”的整合判断。

第二位讲者是来自美国埃默里大学格雷迪纪念医院的王云峰教授，他作了题为《临床微生物实验室的反射性检测》的专题报告。王教授围绕诊断管理（Diagnostic Stewardship）阐述了反射性检测的概念，即在同一标本基础上，根据前一步检测结果自动或规范地决定下一步检测项目，从而减少重复采样和不必要检测，并加快关键结果反馈。他结合咽拭子 A 组链球菌检测、艰难梭菌两步法、梅毒和 HIV 检测流程，以及阳性血培养后快速分子鉴定、耐药基因检测和快速药敏等实例，说明反射性检测可将实验室结果更紧密地衔接到临床决策。王教授强调，反射性检测应成为临床微生物实验室诊断管理的重要组成部分，并需要微生物实验室、感染病团队、抗菌药物管理团队和感控团队协同实施。

第三位讲者是来自梅奥诊所医学与科学学院的姚笃志教授，他作了题为《器官移植后病毒诊断技术的进展与应用》的专题报告。姚教授指出，器官移植受者感染风险与流行病学暴露以及整体免疫抑制状态密切相关，病毒感染尤其需要结合移植阶段和个体风险进行动态监测。他系统介绍了临床病毒学的直接与间接检测方法，并重点讨论了 CMV、BKV 等移植相关病毒的核酸定量检测。姚教授特别强调，即使检测结果均校准至 WHO 国际单位，不同平台之间仍可能存在差异，因此临床随访中宜尽量使用同一检测方法和相同标本类型，并由各移植中心结合具体检测体系和风险人群建立适宜阈值。此外，他还介绍了 BKV 的定期核酸监测策略及 CMV 特异性细胞免疫检测的潜在价值，体现了移植后病毒管理从单次诊断向连续风险评估的发展趋势。

第四位讲者是来自上海市公共卫生临床中心的沈银忠教授，他作了题为《隐球菌的分子流行病学及异质性耐药》的专题报告。沈教授首先结合全球及国内资料介绍了隐球菌病的疾病负担，并指出非 HIV 人群中的隐球菌病同样值得高度关注。围绕分子流行病学，他介绍了 MLST 与全基因组测序（WGS）在揭示隐球菌克隆谱系和菌株内微进化方面的作用，提示相同 MLST 型别并不意味着完全相同的生物学表型。报告重点解析了氟康唑异质性耐药：在总体敏感的菌群中可存在少量高度耐药亚群，常规 MIC 方法可能难以识别，其机制与染色体非整倍体及 ERG11、AFR1 等基因表达变化有关。沈教授进一步介绍了纸片扩散 Δ-zone、PAP 及超 MIC 生长等检测思路，并强调治疗失败或复发时应重新开展药敏评估，警惕异质性耐药向稳定耐药演化的可能。

第五位讲者是来自北京协和医院的杨启文教授。杨教授介绍了《基于宏基因组测序技术的新发病原体实验室识别专家共识（2025版）》的形成背景与核心框架。该共识围绕临床微生物实验室如何规范使用 mNGS 识别新发病原体提出 11 个核心问题和 14 条共识，内容覆盖疑似新发病原体感染的临床识别、标本采集与送检、实验室基本条件、测序及生物信息学分析、质量控制、结果复核与报告、生物安全和信息上报等环节。杨教授强调，对具有特殊暴露史、聚集性发病、病程表现超出既往认知或常规抗感染治疗效果不佳的患者应提高警惕；高度怀疑时可考虑多类型标本留存并联合 DNA、RNA 测序。mNGS 检出疑似新发病原体后，首先从测序质量、特异性、污染风险、多方法验证等方面开展审慎评估，再及时与临床、感控及公共卫生部门沟通。

第六位讲者是来自复旦大学附属中山医院的胡必杰教授。以《非结核分枝杆菌肺病（NTM-PD）与慢性肺曲霉病（CPA）共感染：研究进展》为讲题，胡教授以丰富的临床病例阐释了 NTM-PD 疾病负担，CPA 作为其重要共感染或继发感染问题，需要受到更多关注。现有研究显示，两者可先后发生，也可同时存在，空洞性 NTM、糖皮质激素使用、COPD/ILD、低 BMI 等构成较高风险表型。对于 NTM 治疗不应答、新发咯血、空洞壁增厚等情况，应重新评估 CPA。诊断需综合症状、动态影像、Aspergillus IgG、真菌培养等证据，单一阳性结果不足以确诊。治疗方面，利福霉素强肝酶诱导，会加速三唑类代谢，药物相互作用带来临床矛盾，应通过治疗方案重构、治疗药物监测（TDM）及多学科协作进行个体化管理。

第七位讲者是来自上海交通大学医学院的姚玉峰教授，他作了题为《病原菌血红素合成调控及生物学意义》的专题报告。姚教授围绕病原菌致病机制及宿主天然免疫防御，介绍了团队对沙门菌血红素合成调控机制的研究。通过 Tn-seq 等技术，团队鉴定到可抑制巨噬细胞吞噬的调控因子 SirM，并发现 SirM 具有甲基转移酶功能，可通过甲基化 HemL 促进细菌血红素合成。进一步研究显示，细菌血红素不仅可抑制巨噬细胞吞噬，还可促进巨噬细胞焦亡；SirM 同时能够增强病原菌在肠道中的竞争优势。姚教授的研究从蛋白质翻译后修饰和代谢调控角度揭示了病原菌逃逸宿主免疫的新机制，也为理解细菌毒力形成提供了新的研究线索。

上午会议围绕病原体直接检测、宿主反应评估、实验室流程优化及病原致病机制等多个层面展开，既展示了 mNGS、WGS、人工智能等新技术在感染病诊断中的最新进展，也强调了检测标准化、结果临床解释和多学科协作的重要性。圆桌讨论环节，中美专家与参会代表进行了深入的互动交流，进一步拓展了临床微生物从“检出病原”向“精准解释与临床决策支持”发展的思路，为感染性疾病精准诊疗和临床微生物学科建设提供了有益参考。

上午主旨报告由上海交通大学医学院附属瑞金医院倪语星教授、空军军医大学西京医院郝晓柯教授、海军军医大学戚中田教授、复旦大学钟江教授、上海市中医医院刘庆中教授、上海市临床检验中心王敬华教授以及上海交通大学医学院附属仁济医院刘倩教授分段轮流主持。圆桌讨论会由上海交通大学医学院刘宁宁教授主持。

简短午休后，下午学术报告精彩继续。

来自哥伦比亚大学医学中心的吴蘩教授作了题为《临床微生物实验室与临床科室的合作共赢》的专题报告。吴教授指出，面对重症感染和耐药菌不断增加的临床挑战，临床微生物实验室不应局限于传统的“收标本—出报告”模式，而应从单纯提供检验结果逐步转向参与临床诊疗全过程。她从标本采集、检测策略选择、结果解释和临床沟通等环节介绍了微生物实验室与临床科室深度协作的实践经验，强调高质量标本是获得可靠病原学结果的前提，而检验结果只有结合患者病情、标本来源、感染部位及病原体特征进行综合判断，才能真正转化为临床可执行的信息。通过危急值主动沟通、微生物晨间查房、病例讨论及全天候专家咨询等方式加强实验室与临床的实时互动，从“检验服务”进一步走向“临床服务”，共同提高病原学诊断水平和抗菌药物合理应用能力。

复旦大学附属华山医院张文宏教授作了题为《基于微生物诊断的抗菌药精准诊治》的专题报告。张教授围绕微生物诊断如何更有效地服务抗菌药物精准治疗展开论述，指出感染性疾病诊疗正在由经验性用药逐步向病原学证据支持下的精准治疗转变。临床微生物检测的价值不仅在于明确“检出了什么病原体”，更重要的是结合感染部位、宿主状态、病原体致病性以及药物敏感性等信息，判断检测结果与临床感染之间的真实关系，并据此指导抗菌药物的选择与调整。张教授强调，快速病原检测、药敏试验及耐药机制分析需要与患者临床表现和治疗反应相结合，同时加强感染科、临床微生物实验室及药学等多学科协作，通过动态评估及时优化或调整治疗方案，从而推动抗感染治疗由经验驱动进一步走向证据驱动和个体化精准诊治。

来自布朗大学附属罗德岛医院的洪陶教授作了题为《免疫功能低下患者侵袭性真菌感染的诊断》的专题报告。洪教授结合典型病例，系统介绍了免疫功能低下患者侵袭性真菌感染的实验室诊断策略。她指出，侵袭性念珠菌病、曲霉病及其他机会性真菌感染在免疫功能受损患者中具有较高风险，准确诊断首先取决于合理的标本采集和送检，必要时应优先选择组织、无菌体液等具有较高诊断价值的标本，并加强临床与实验室之间的沟通。直接镜检能够快速提供真菌感染线索，培养、MALDI-TOF质谱、药敏试验以及分子检测则可进一步完成病原鉴定和耐药评估。此外，隐球菌抗原、半乳甘露聚糖和β-D-葡聚糖等真菌生物标志物可在不同临床场景中发挥辅助诊断作用。洪教授强调，不同检测方法各有优势和局限，应根据患者免疫状态、感染部位及疑似病原体合理组合应用，以提高侵袭性真菌感染的早期识别能力。

深圳市第三人民医院的卢洪洲教授作了题为《艾滋病功能性治愈创新技术路线多中心临床研究及评价》的专题报告。卢教授围绕艾滋病功能性治愈的创新技术路线及临床转化进行了系统介绍，并结合团队“产—学—研—医—检”一体化平台建设，展示了相关技术从基础研究、产品开发到临床评价的转化路径。报告重点介绍了以肠道菌群为靶点的膳食干预研究，研究显示，持续12周的膳食干预可调节HIV感染者肠道菌群特征，并对心血管代谢相关指标产生改善作用，为降低HIV感染者心血管疾病风险提供了新的非药物干预思路。卢教授同时介绍了干细胞及iPSC等细胞治疗技术的发展趋势，以及相关临床转化和规范化管理路径。在此基础上，团队进一步围绕HIV潜伏病毒储存库开展功能性治愈研究，通过多中心协作探索潜伏病毒再激活等新的技术策略。卢教授指出，艾滋病功能性治愈需要基础研究、创新技术和规范化临床评价相结合，通过多技术路线协同推进，逐步为HIV感染者长期控制甚至功能性治愈提供新的可能。

同济大学附属东方医院吴文娟教授作了题为《病原微生物感染的即时诊断和监控》的专题报告。吴教授围绕感染性疾病即时检测（POCT）的临床定位、技术进展及质量管理进行了系统介绍。她指出，POCT的核心价值并不仅仅在于检测速度快，而在于检测结果能否进入患者的“临床决策窗口”，及时影响首诊判断、抗感染治疗和感染防控。随着分子POCT逐步进入分钟级检测时代，其应用已由疫情期间的应急检测进一步拓展至脓毒症、呼吸道感染及门急诊感染等临床场景。吴教授强调，对POCT的评价应从单纯关注准确率转向兼顾“时效与准确性”，同时加强分析前、分析中和分析后的全过程质量管理。未来通过实时质控、网络化连接、人工智能辅助判读以及多机构远程管理，可逐步建立“检测—监测—预测”一体化的感染预警体系，推动POCT向智慧化和规范化方向发展。

来自东北俄亥俄医科大学附属阿克伦儿童医院的郑晓天教授作了题为《儿童脓毒症诊断的进展》的专题报告。郑教授从儿童脓毒症及血流感染的临床危害出发，重点介绍了血流感染实验室诊断流程及快速诊断技术的发展。她指出，及时给予有效抗菌药物对于严重感染患者的预后至关重要，而病原体耐药可显著影响经验治疗效果，因此快速获得病原鉴定及药敏结果具有重要临床价值。血培养目前仍是疑似脓毒症和血流感染的重要病原学检测手段，并可进一步提供药敏依据；在此基础上应用多重PCR、直接质谱等快速鉴定技术，可明显缩短病原鉴定时间。郑教授进一步介绍了快速药敏技术的进展，强调“血培养＋快速病原鉴定＋抗菌药物管理”的联合模式有助于更早实现针对性治疗，对于耐药菌感染及感染性休克患者尤其具有潜在价值。

中国科学技术大学附属第一医院马筱玲教授作了题为《成人脓毒症诊断技术进展与指南更新》的专题报告。马教授结合病例及最新脓毒症指南更新，系统介绍了成人脓毒症的诊断理念和实验室检测进展。她指出，脓毒症本质上是感染所致宿主反应失调并导致危及生命的器官功能障碍，其诊断仍需以临床综合判断为基础，不能依赖单一生物标志物或单项实验室检测。报告重点介绍了血培养、乳酸、PCT以及新型宿主反应标志物等在脓毒症诊疗中的应用，并强调血培养应尽可能在抗菌药物使用前采集，但不可为等待采血而延误抗感染治疗。与此同时，多组学、宿主与微生物mNGS以及人工智能模型正在为脓毒症早期识别提供新的研究方向，但其临床价值仍需更多证据验证。马教授强调，应将病原学检测、宿主反应、器官功能及患者动态变化进行综合评估，以进一步提高脓毒症早期诊断和精准治疗水平。

清华大学生物医学工程学院胡晔教授作了题为《微纳技术助力临床微生物精准检测》的专题报告。胡教授围绕临床感染诊断中的未满足需求，介绍了微纳技术、CRISPR分子诊断及多组学技术在病原精准检测中的创新应用。针对结核病仍高度依赖痰液检测、部分患者难以获得合格痰标本等问题，团队从循环病原标志物入手，探索结核分枝杆菌游离DNA、特异性肽段及细胞外囊泡等非痰液诊断标志物，并进一步开发抗原特异性T细胞应答芯片，通过4-1BB、OX-40等标志物提高结核感染识别能力，为HIV感染者及肺外结核等复杂人群的诊断提供新的技术路径。针对传统POC检测对实验室条件和设备依赖较高的问题，胡教授还介绍了结合RPA-CRISPR和冻干试剂的便携式检测系统，以提升检测的快速性和现场应用能力。在非结核分枝杆菌检测方面，团队进一步构建CRISPR辅助的纳米液滴多重检测平台，通过荧光编码、特异性gRNA设计及图像自动分析，实现多种NTM及近缘亚种的同步鉴别。胡教授强调，微纳技术与分子诊断的融合有望推动病原检测由传统实验室检测进一步向高灵敏、多重化、便携化和即时化方向发展，为感染性疾病精准诊断提供新的技术支撑。

复旦大学附属华山医院抗生素研究所胡付品教授分享了题为《细菌药敏试验高级专家规则的建立、开发及实战应用》的报告。胡教授从临床耐药菌感染和新型抗菌药物应用面临的实际问题出发，介绍了药敏试验高级专家规则在结果审核、耐药机制判断和临床报告解释中的重要作用。他指出，药敏结果并非简单的“敏感”或“耐药”，一些矛盾表型、罕见耐药表型以及特殊耐药机制需要结合菌种特征、耐药机制和既往积累的大量数据进行判断。通过多个实际案例，胡教授展示了专家规则在纠正异常药敏结果、推测耐药机制、推导药物敏感性、提示天然耐药以及指导耐药监测等方面的应用价值。随着人工智能技术的发展，高级专家系统可进一步整合大规模药敏数据与专家经验，辅助识别矛盾结果并给出解释性提示。

来自华大北京研究院的邓子卿教授作了题为《DCSP多组学+AI在病原感染领域的应用》的专题报告。邓教授围绕多组学技术与人工智能在病原感染研究及临床诊断中的融合应用进行了介绍，以D-基因组/宏基因组学、C-细胞转录组学、S-空间转录组学和P-蛋白组学为核心，展示了从自然疫源病原监测、新发病原发现，到感染队列多组学研究、宿主标志物挖掘及空间微环境解析等多层次研究路径。他还介绍了高通量测序自动化平台及AI智能体在病原检测和结果辅助解读中的探索，推动病原诊断由单纯识别微生物逐步向整合病原体信息、宿主免疫状态和时空动态信息发展。未来DCSP多组学与AI的真正临床价值仍需回归患者获益和成本效益，通过多模态数据融合和智能决策进一步提升复杂感染及新发感染的精准诊疗能力。

来自微远基因的李永军教授作了题为《从过去十年看未来十年：mNGS临床转化与规范应用》的专题报告。他以mNGS近十年的发展历程为主线，系统回顾了该技术从感染病例中的探索性应用，逐步走向临床转化、规范化建设和产品化应用的过程。过去十年间，mNGS在中枢神经系统感染、下呼吸道感染、脓毒症及新发突发传染病等场景中的临床证据不断积累，并陆续被纳入多项专家共识、指南及国家标准，推动其从第三方检测逐渐向医院本地化检测和规范化临床应用发展。mNGS正逐步进入更加标准化、合规化的临床应用阶段。展望未来，他提出mNGS将由单纯病原体鉴定进一步向病原分型、耐药与毒力解析、宿主免疫状态评估以及多模态人工智能辅助决策方向拓展，通过融合病原、药物和宿主多维信息，进一步服务感染性疾病精准诊疗。

最后，重庆医科大学汤一苇教授进行大会总结。论坛通过前沿成果分享与深入交流，为临床微生物检测技术创新、感染性疾病精准诊疗及多学科协作搭建了高质量交流平台，也进一步推动了临床微生物学向精准化、规范化和智能化方向发展。他指出，本次论坛的圆满举办，凝聚着中美两国专家学者与全体参会同道的智慧与心血，为感染性疾病诊疗水平提升及学科高质量建设注入新的动力。期望双方在临床微生物领域的学术交流薪火相传、行稳致远。